Update dependencies for building

src/Makefile.dep

@@ -106,6 +106,7 @@ obj/mode_merge.o :  \
 	obj/atoms.o \
 	obj/elements.o \
 	obj/io.o \
+	obj/neighbors.o \
 	obj/parameters.o \
 	obj/subroutines.o
 
@@ -143,6 +144,7 @@ obj/opt_group.o :  \
 	obj/box.o \
 	obj/elements.o \
 	obj/parameters.o \
+	obj/sorts.o \
 	obj/subroutines.o
 
 obj/opt_orient.o :  \